Осень 2030 года. Добыча редкоземельного ила на отдаленном острове Минамитори, самой восточной точке Японии, должна была стать козырем, позволяющим стране вырваться из статуса «ресурсно-бедной державы». Однако третья платформа добывающего комплекса «МИНЕРВА» взлетает на воздух на рассвете, унося жизни двенадцати человек. Правительство объявляет это несчастным случаем из-за износа оборудования, но Национальное агентство по особым поручениям (NIA) квалифицирует происшествие как диверсию государственного масштаба — теракт. За спиной взрыва маячат тени Китая, России и Северной Кореи, однако правительство, опасаясь дипломатического скандала, не решается действовать. NIA втайне отправляет на остров команду, чтобы предотвратить новый удар и выявить заказчика. В составе группы — Асакура Исаму, новичок, который еще полгода назад был обычным гражданским. Пройдя адскую подготовку и боевое крещение, он вместе с опытным агентом Химуро Рэйкой ведет разведку на острове. Им удается вычислить внутреннего сообщника и иностранных шпионов. Вскоре выясняется: вражеская база — это подводная лодка ВМС Китая, скрывающаяся у берегов, а операцией руководит легендарный агент «Черная змея».