В альтернативной Японии, отличной от нашей, разворачивается трёхчастная человеческая драма. Её главные герои — Аямэ, её напарник Сю и загадочная Сумирэ. В эпоху Бакумацу сёгунские войска попытались использовать ниндзя, прославившихся в Смутное время, для убийства лидеров императорской армии. Однако план провалился, и многих ниндзя казнили как мятежников. Прошли годы, наступила эпоха Тайсё. Япония, совершившая рывок благодаря механической революции, принесённой чужеземцами, стала империей и вступила в войну с великими державами. После двух крупных конфликтов Японская империя процветает. Аямэ, чью семью убили солдаты империи, живёт лишь местью. Используя навыки убийцы и механическое вооружение, она занимается заказными убийствами.