Десять лет назад извержение Фудзиямы породило «разлом», ставший вратами в иное измерение. Его влияние незаметно проникло в Японию, начиная разъедать сознание людей в виде «синхросигнала». Итиро Яманака, работающий в Икэбукуро, переживает таинственную тьму, когда мир исчезает на десять секунд. Вместе с семью другими, ощутившими эту аномалию, он собирается в подземном конференц-зале. Ученый Хисаси понимает: это «внешний синхросигнал», призванный унифицировать человеческое сознание. Восьмерка сбегает на фургоне в горную деревню Ибараки, откуда исходит сигнал. Там звук исчез, а люди превратились в «терминалов», повторяющих одни и те же действия. Взрыв завода натто открывает подземный разлом, и герои попадают в лабиринт, пульсирующий, словно живая ткань. В центре — гигантское ядро, к которому способен подключиться только Итиро, обладающий иммунитетом после встречи со светом разлома десять лет назад. Инопланетное существо спрашивает Итиро о ценности человеческого мира. «Несовершенство — вот признак жизни», — отвечает он, нарушая сигнал и обрушивая сеть синхронизации. Третье отключение становится перезагрузкой мира и ключом к спасению человечества.