В недалёком будущем по всему миру появляются люди со сверхспособностями, которых называют «призраками». Обычный школьник Миюки Амэмия внезапно пробуждает в себе способность «Анимус» и становится изгоем: его преследуют полиция и СМИ, а семья и школа отворачиваются от него. В поисках места в жизни он присоединяется к команде призраков «Уроборос», но попытка остановить разгул насилия приводит к уничтожению группы и тяжёлому ранению самого Миюки. Двадцать лет спустя он пробуждается из криогенного сна и оказывается заперт в Токийском особом исправительном округе — городе-тюрьме, окружённом высокой стеной. Здесь, среди руин Токио, он встречает детективов Рюсэя Акагами и Сиро Тоон, которые охотятся на опасных преступников-призраков, известных как «Палачи». Миюки отказывается от предложения присоединиться к ним, не желая больше убивать, но лишённый закона и порядка мир безжалостно втягивает его в водоворот кровавых событий. Это история о бывшем полицейском, священнике, наёмнике, бывшем убийце, девушке с мечом, хакере и мужчине, которого называют Смертью. Они — команда вершителей судеб, несущая возмездие в мире, где каждый шаг может стать последним.