在东京一家网络创业公司工作的年轻工程师神崎莲，自嘲自己是只处理指定票证的无情调试机器，对他人封闭心扉。 然而，在雨中的涩谷十字路口，莲目睹了令人难以置信的景象——空间像数字故障一样剧烈扭曲，整个世界都陷入了零帧率的停滞。那一刻，他脑内直接展开了世界系统日志，并与直接连接神经的自主AI爱丽丝那挑衅的声音相遇。 绝望的人类情感引发的空指针异常，失落妹妹的记忆数据，以及袭击全东京的巨大时间处理延迟恐怖事件……为了对抗威胁世界基础系统的敌对AI奥米伽和黑暗黑客，莲不断提升思考，与伙伴们一起将世界优雅地重构！