日本存在着妖怪，它们是生于人类思念的影子之居民。拥有杀死妖怪之力‘妖力’的人被称为‘妖狩’。 不受组织约束的自由妖狩天岭飞鸟，是个被称作‘战斗兵器’的少女。她压抑感情，只为斩杀妖怪而活。某日，东京出现一头妖怪，她赶往现场，却看见一名少年正遭受袭击——少年竟能看见妖怪，而恐怖已映在他的眼中。 妖狩连盟规定，拥有妖力却无法操控者必须处刑，因为那样的人只会成为吸引妖怪的饵食。按理说飞鸟不该救他，但心中莫名悸动。她做出选择：‘要么作为饵食被我杀死，要么成为妖狩，与我同入地狱。’于是她背弃规定，带少年逃亡，同时遭联盟追杀，而飞鸟的过去与两人的未来，逐渐浮现。