Туманный Токио эпохи Мэйдзи. Город, стремительно превращающийся в современную державу, хранит мрачную тайну: за фасадом прогресса пробуждаются забытые людьми аномалии - ёкаи и злые духи. Имперское правительство тайно создаёт отряд «Кабарай», собрав в нём потомков мастеров инь-ян и древних синтоистских жрецов. Один из членов отряда, Хираги Кадзума, потерял часть воспоминаний в результате трагического происшествия, но обладает уникальной способностью считывать духовные остатки других людей. Вместе со своим хладнокровным напарником Сигаокой, наследником искусства инь-ян, Кадзума расследует череду сверхъестественных инцидентов. Постепенно они выходят на след таинственного бедствия «Пламя алого зла» и стоящего за ним тёмного общества «Кокка-но Кай». Юному изгоняющему предстоит сражаться с тенями из тьмы, раскрыть правду и защитить столицу, превратив безымянные молитвы в свой клинок.