В современной Японии существование «магов», способных с помощью «магической силы» творить сверхъестественные чудеса, стало общеизвестным фактом. Однако маги остаются меньшинством и порой становятся объектами дискриминации. На фоне роста преступлений с участием магов старшеклассник-маг Кагура Манато, состоящий в «Японской магической ассоциации», созданной для борьбы с такими инцидентами, разрывается между учебой и расследованиями. Во время очередного задания он встречает загадочную девушку Минори Риону, потерявшую память. Эта встреча втягивает Манато в водоворот интриг, способных потрясти весь мир.