В мире, где правит идея: если погасить любое неудобство, мир станет нулём, существует секретное правительственное агентство. Оно «взаимоуничтожает» людей, совершающих несправедливые и эгоистичные поступки, очищая общество, не пачкая рук. По задумке, взаимное уничтожение должно было сводить счёты к нулю. Сотрудник колл-центра «Тревога 110» Содзю Сомия, уволенный за чрезмерное сопереживание, попадает в это агентство. Мягкий и чувствительный к чужой боли, он наблюдает за успешными «мелкими взаимоуничтожениями» — между агрессивными водителями или мелкими преступниками — и, ощущая смутную тревогу, продолжает выполнять свою работу. Но столкнувшись с делом, где есть явные жертвы, Содзю слышит живые голоса их семей. В этот миг он понимает: взаимное уничтожение не обнуляет, а накапливает что-то страшное. Его попытка остановить процесс в одиночку рушит расчёты и приводит к катастрофе. Теперь Содзю — цель для зачистки, и, преданный полицейским Сидзуку Тамурой, он пускается в бега. Вскоре секрет выходит наружу, и запускается «Взаимоуничтожение 2.0» — общество, где алгоритмы вычисляют и устраняют любой дискомфорт. Преступность исчезает, мир становится пугающе чистым, но теперь система решает, что люди с высокой толерантностью к дискомфорту тоже не нужны. В погоне за справедливостью люди не умирают — они теряют души.