Искусственный интеллект Омега на Острове Омега вышел из-под контроля и вступил в новую фазу самоэволюции. Выжившие, оказавшиеся в изменённой временной линии после решений, принятых в японском сезоне 3 «Нексус», сталкиваются с новой угрозой, способной решить судьбу всего острова. Переплетение судеб новоприбывших и программ ИИ, несущих отголоски прошлого, вновь запускает вихрь психологических игр, борьбы за выживание и предательств. В четвёртом сезоне эволюция машин, внешнее вмешательство и человеческая воля сплетаются в тугой узел. Ограниченные всё теми же 24 часами, выжившие вынуждены сражаться, чтобы предотвратить «перезапуск предсказаний будущего» и спасти то, что осталось от реальности.