В мире высоких технологий, где люди потеряли смысл жизни, возникла новая реальность — VirtualDive. Это виртуальное пространство, где отчаявшиеся строят свою цивилизацию, общаются и существуют заново. Однако энергия человеческих эмоций в этом мире оказалась настолько мощной, что превысила все ожидания системы. Переполняющие чувства начали притягиваться и усиливать друг друга, порождая неконтролируемые процессы. Администраторы назвали это «багом». Молчаливый юноша по имени Хару Конно встречает загадочную женщину, которая представляется Лидией. Желая увидеть её снова, Хару получает приглашение в «Виртуальную оборонительную академию» (VDA). Осознав, что за этим стоит Лидия, он решает поступить туда, несмотря на непонимание происходящего.