Суматоха, поднятая Юдзи и Синдзи в Эдо, была лишь вершиной айсберга. В тени этих событий тайно вершился план господина управителя. Судьба неоднозначных убийц из клана Идатания разворачивается после основной истории. Это продолжение, берущее начало с эпилога основного сюжета «Последнего самурая». Киото погружается во мрак — здесь орудует таинственный ликвидатор, а на его поиски отправляются Рин и Сэйсиро из Идатания. В отличие от основной части, эта история выдержана в более серьёзном тоне. Настоящая историческая драма с привкусом крови и стали.