Земля погибла из-за исчезновения озонового слоя. Человечество переселилось в виртуальный мир в виде «цифровых данных». Города и небо были воссозданы, и мирная жизнь продолжалась… так должно было быть. Но десять лет спустя таинственные существа «Бугуа» начали стирать людей как «ненужные данные». Их лидеры, «Апостолы бедствия», не просто сильны — они отнимают сами эмоции, лишая воли к борьбе. Против них могут сражаться только воины в боевом снаряжении «Люминус Гир» — Люминус Манифестеры. Главный герой, Каминари Масато, замечает странность: только у него «время смещено». Это ощущение перерастает в способность «стирать время». Тем временем его соратница Мико страдает от загадочного недуга, а брат Сэйто прибегает к запрещённой «Потерянной программе».