«Слышал, как вынимают сердце?» — с этого вопроса начинается утро первого дня третьей четверти. Переведённая ученица Итикава Тика, словно ведомая подобранным по дороге в школу яблоком, ступает на школьную крышу. Там её ждут холодный дождь, грустная детская песенка и «госпожа Яблоко» — мстительный дух школьницы, чей изуродованный труп нашли ещё в военное время. Так начинается странная школьная жизнь, полная загадок. Постепенно раскрывается тёмное прошлое Тики и правда о «госпоже Яблоко». Девушка встречает девушку на границе между обыденностью и небытием, где реальность переплетается с кошмаром.