2040 год. Пытаясь использовать геотермальную энергию, человечество бурит земную кору и сталкивается с неизвестными существами под землей. Эти создания выходят на поверхность и проявляют враждебность к людям. К 2050 году мир теряет 99,9% населения и оказывается на грани вымирания. В Японии, где втайне разрабатывали клонирование для борьбы с демографическим кризисом, на поле боя выходит особое оружие — «Макина». Это клонированное устройство: даже погибнув, оно сохраняет память до предыдущего дня, если мозг удаётся вернуть, и продолжает сражаться. Ай — оператор «Макины» и её командир. В мире, несущемся к гибели, их сердца пересекаются…