Действие разворачивается в таинственном мире Генсокё, где люди и ёкаи сосуществуют под неусыпным надзором мудрой госпожи Якумэ. Однако спокойствие нарушается, когда на небесах происходит загадочное событие, угрожающее самому существованию этого хрупкого равновесия. В центре сюжета — Рейму Хакурей, наследница древнего храма, и её верная подруга Мариса Кирисамэ. Вместе с другими обитателями Генсокё они отправляются в рискованное путешествие на Луну, чтобы раскрыть тайну, скрытую за «безумным бегством» императора. По пути герои сталкиваются с могущественными врагами, древними заклинаниями и предательством. Смогут ли они предотвратить катастрофу и вернуть мир в свой дом, или же лунная клетка навсегда поглотит их?