Действие разворачивается в 2033 году в Токио, столице Японии, почти полностью восстановленной после разрушительного землетрясения в Нанкайском жёлобе. Человечество достигло целей устойчивого развития, а общество построено на гармонии передовых технологий, заботы об экологии и уважения к расовому и гендерному разнообразию. Наука шагнула далеко вперёд: создан универсальный ИИ, сверхэффективные солнечные батареи работают даже в дождь, а в камерах выращивают искусственные сетчатки из стволовых клеток. В 2027 году гарвардские учёные совместно с палеонтологом Джеком Хорнером совершили прорыв — им удалось отредактировать гены куриного эмбриона и вывести птенца с чертами динозавра. Эти существа получили название «неорнитизавры». Главный герой, самец, родился в лаборатории Гарварда в июне 2028 года, а в десять месяцев был передан в зоопарк Тама в Японии. Но через год на страну обрушилось землетрясение магнитудой 9 баллов, разрушившее всё вокруг. Зоопарк был уничтожен, но герой, благодаря острому зрению и пространственному мышлению, сумел выбраться из-под завалов. В поисках выживания он встретил других необычных существ — расово, гендерно и биологически разнообразных союзников. Вместе они не только выжили, но и дали отпор ультраправой партии «Партия здравого смысла», а затем и её более опасному преемнику — международной экстремистской организации «Чистокровная революция», выступающей против технологий, разнообразия и защиты окружающей среды. В предыдущей части герои уничтожили японское отделение этой группировки. Теперь, получая финансирование от президентов России и США, «Чистокровная революция» продолжает влиять на политику по всему миру, и главному герою с его растущей командой предстоит новый виток борьбы.