12 июня 1974 года из космоса исходит таинственный свет, и на Землю внезапно вторгаются внеземные существа — «Монстры (Зеролей)». Это событие, позже названное «Первым вторжением Монстров», приносит человечеству колоссальный ущерб, оставшийся в мировой истории. Перед лицом неизвестной угрозы люди оказываются на грани уничтожения, но в тот же момент у некоторых пробуждается сила, способная противостоять врагу — «Духовная сила (Спирит)». Они сокрушают монстров одну за другой. Спустя двадцать лет, в 2020 году, человечество создаёт организацию «Гипер Бастеры» (сокращённо — Гейт) с базой в Японии. Когда начинается «Второе вторжение Монстров», люди во главе с «Гипер Бастерами» дают отпор, сводя ущерб к минимуму. Теперь эта организация становится официальной и могущественной по всему миру. В 2026 году около 40% населения пробуждают Духовную силу, а некоторые обретают особые способности. Главный герой, Фуругара Ито, не вступает в «Гипер Бастеры», а работает нелегальным «Охотником (Аутсайдером)», защищая Японию и мир, уничтожая монстров по частным заказам.