Действие разворачивается в альтернативной версии Японии, названной Великая Япония, где сёгунат Токугава сохранил власть и страна осталась изолированной от остального мира. Сюжет сосредоточен вокруг академии Буо, расположенной у подножия горы Фудзи, где дети военных семей обучаются искусству самураев. Академия охвачена борьбой за власть между фракцией Тоётоми во главе с Юкимурой Санадой и Матабэем Гото, а также могущественным студенческим советом, управляющим школой. В этот конфликт оказываются втянутыми Мунэакира Ягю, владелец додзё Ягю, и загадочная Дзюбэй Ягю. В сериале фигурируют знаменитые исторические личности из периода Сэнгоку и раннего периода Эдо в Японии. Кроме того, персонаж Шарль д'Артаньян также родом из той же эпохи в Европе.