Юноша по имени Кудзё Тэцуто ведёт жизнь без цели, перебиваясь случайными заработками. Однажды ночью, после того как он убивает человека, ему встречается загадочная девушка, которую он решает спасти. Этот поступок запускает цепь событий, меняющих его судьбу навсегда. Тэцуто оказывается втянут в мир секретной оборонной организации «Алькасар», использующей «Девочек-машин геноцида» — оружие массового уничтожения, созданное во время мировой войны. Он знакомится с Первой — японским боевым андроидом-убийцей, которая видит в нём угрозу. Вскоре выясняется, что тело Тэцуто само стало опаснейшим химическим оружием, способным вырабатывать вещество «N». С помощью новых союзников — сереброволосой девушки по имени Хикари и её странной начальницы — Тэцуто пытается уничтожить Первую и раскрыть тайны организации, превратившей его в ходячую бомбу. Но впереди его ждёт ещё более шокирующая правда о его собственном теле и истинной природе мира, где «Девочки-машины геноцида» стали реальностью.