В современной Японии Мидзуки Сакуя, особый советник клана Сихоин, иногда видит сны о незнакомом мире. Во сне появляется девушка по имени Сакуя, которая называет себя его будущей дочерью. Она рассказывает о гибели антинаталистской звезды Эдем и о существовании другого Мидзуки Сакуи, который сражался и исчез, используя его имя. Отправившись по заданию в Аомори, Сакуя встречает девушку Сайку, окружённую молниями. Её крик о помощи становится началом истории Чёрного рыцаря и девушек трёх цветов. Им предстоит столкнуться с тайнами миров и судьбой, что связывает их жизни.