С детства Абэ Аканэ видела то, что видеть не должна. Сущности, называемые духами, тихо изолировали её от окружающих. В заснеженный день у синтоистского храма она встретила гениального мальчика Морияму Сатору. Он не видел духов, но именно он точно понял её одиночество. Вместе они начинают исследовать устройство, воспроизводящее само человеческое восприятие — «прибор для видения духов». В ходе исследований рождается механическое живое существо Мирай, созданное для наблюдения и воссоздания мозговых волн. Существующий ради завершения прибора, он обретает семью и постепенно восстанавливает утраченные чувства. Но вторжение неопознанных враждебных форм жизни начинает подводить мир к концу. Рождённый как механизм, он должен сделать тихий, но решающий выбор: остаться с человечеством или...