2022 год. Человечество процветает благодаря компьютерной системе Сефирот, способной создавать бесконечные вычислительные мощности внутри особого пространства. Эта технология породила новый вид занятости для людей с психическими расстройствами: им вживляют мозговые импланты для прямого подключения к системе. Один из таких работников - Мицуру Накаяма, который управляет фэнтезийной MMORPG в виртуальной реальности. Он приносит компании огромную прибыль, но каждый раз после успешного запуска его переводят на другой проект. Общество считает, что психически больные обязаны отрабатывать своё существование. В один роковой день, подключившись к системе, Мицуру вспыхивает и сгорает заживо от неизвестной энергии. Очнувшись, он обнаруживает, что слился с игровой системой творения и стал Deus Gear - божественной машиной. Вместе со своими новыми подчинёнными и системой он переносится в другой мир, где начинает искать причины своего превращения и осваиваться в роли механического бога.